Предпосылкой для создания в Хакасии технического вуза явилось то, что с середины 60-х годов XX века началось формирование на юге Красноярского края Саянского промышленного территориально-производственного комплекса. Чтобы успешно решить задачи этого грандиозного строительства, Хакасии потребовалась значительная кадровая перестройка. Поэтому и было принято решение об открытии в г. Абакане общетехнического факультета (ОТФ) Красноярского политехнического института. Торжественное открытие факультета состоялось 28 февраля 1968 года. Возглавил общетехнический факультет кандидат физико-математических наук Василий Владимирович Кошманов. Первыми слушателями стали 69 студентов заочного факультета Красноярского политехнического института (КрПИ), проживающих в Хакасии и на юге Красноярского края. В том же 1968 году был осуществлен первый набор первокурсников в количестве 150 человек. В последующие годы шло активное становление вуза, формирование высококвалифицированного педагогического коллектива и развитие материальной и лабораторной базы. С апреля по август 1972 года обязанности декана ОТФ выполнял Виталий Валентинович Рукосуев.
Быстро развивающийся Саянский промышленный территориально-производственный комплекс требовал притока новых инженерных кадров, поэтому в 1972 году общетехнический факультет был преобразован в филиал Красноярского политехнического института в г. Абакане, работу которого возглавил кандидат технических наук Василий Фёдорович Рябихин.
В 1976 году была открыта дневная форма обучения с приёмом 150 человек по трём специальностям: «Промышленное и гражданское строительство», «Технология машиностроения», «Электроснабжение промышленных предприятий».
Первоначально основу педагогического коллектива филиала составляли высококвалифицированные специалисты, приехавшие из разных уголков страны: Л. В. Замаратская, М. З. Кошманова, О. А. Иваненко, В. В. Опарин, М. И. Желтобрюхов, В. Г. Лесникова, Н. С. Марченко, Г. С. Сурвилло и Г. Ф. Сурвилло, М. А. Костин, К. Х. Кан, Ю. В. Горст, И. И. Вишневецкий, Л. А. Авдеев, Г. П. Нагорный, Э. Р. Гофман, А. Д. Гофман, А. Ф. Коробейников и А. Н. Коробейникова, Г. М. Зайнуллин и С. П. Зайнуллина, Д. П. Попов, М. К. Сарлин и др. Начиная с 80-х годов рост кадрового потенциала шел в основном за счет собственных резервов.
В 1986 году директором института назначен доктор технических наук, профессор Владислав Иванович Максак. В 1994 году филиал Красноярского политехнического института в Абакане был переименован в Хакасский технический институт Красноярского государственного технического университета. Затем в 1999 году – в Хакасский технический институт — филиал Красноярского государственного технического университета (ХТИ – филиал КГТУ).
С 1999 года директором ХТИ – филиала КГТУ становится кандидат технических наук Сергей Иванович Рябихин. В период его руководства в институте были созданы новые подразделения, увеличен контингент студентов, значительно улучшена материальная база, открыты новые специальности: «Экспертиза и управление недвижимостью», «Прикладная информатика в экономике», «Электропривод и автоматика промышленных установок и технологических комплексов», «Автомобильные дороги и аэродромы».
Более половины руководителей высшего и среднего звена управления предприятий и организаций Республики Хакасия – выпускники ХТИ – филиала КГТУ. В 2000 году создана общественная организация «Ассоциация выпускников ХТИ – филиала КГТУ». По представлению Правительства РХ ХТИ – филиалу КГТУ присвоено звание Лауреата первого Всероссийского конкурса «Трудовая слава России 2000».
В 2006 году ХТИ – филиал КГТУ вошёл в состав Сибирского федерального университета и был переименован в ХТИ – филиал СФУ.
В 2007 году институт возглавил кандидат юридических наук Алексей Александрович Пантелеев. В 2007 года Хакасский технический институт – филиал СФУ отметил свой 40-летний юбилей. Накануне праздника было подписано трехстороннее соглашение о сотрудничестве между Правительством Республики Хакасия, ФГОУ ВПО «Сибирский федеральный университет» и предпринимателями Республики Хакасия.
В июне 2010 года был изменён тип ФГОУ ВПО «Сибирский федеральный университет» на автономное учреждение. В связи с этим Хакасский технический институт – филиал федерального государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования "Сибирский федеральный университет" был преобразован в Хакасский технический институт – филиал федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего профессионального образования "Сибирский федеральный университет".
С 2010 по 2014 года институт возглавляла кандидат экономических наук Наталья Валериевна Дулесова.
С апреля 2014 года директором ХТИ – филиала СФУ является доктор биологических наук, доцент Елена Анатольевна Бабушкина.
Приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 16.12.2015 г. №1481 Хакасский технический институт – филиал федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Сибирский федеральный университет» был переименован в Хакасский технический институт – филиал федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего образования «Сибирский федеральный университет».
ФГАОУ ВО «Сибирский федеральный университет» вошел в проект 5-100, нацеленный на повышение конкурентоспособности ведущих российских вузов и укрепление их позиций в международных рейтингах.